区别在于：
（1）融资融券包括两部分，即融资与融券，前者是证券公司借给客户一部分资金，客户可以买入更多的股票，等卖出后再将本金以及相应利息归还给证券公司；融券是指证券公司借给客户一部分股票，客户可以先将借来的股票卖出，等买回以后再将同样数量的股票以及产生的利息还给证券公司。但配资仅仅是指按一定比例向交易所外的机构借取资金。
（2）融资融券需要一定的担保物，可以是货币，也可以是债券、股票等有价证券，所以自始至终都在自己的账户内运作；配资一般都需要将自己的资金打入公司要求的账户进行运作。
（3）融资融券的对象只有相应标的，一般软件上标注“R”；配资因为相当于借钱炒股所以没有限制。
（4）融资融券的杠杆比例由交易所制定，所以重视风险，杠杆较低；配资的比例由外面公司自己设定，高低都不等，一般在融资融券1倍。

目前配资在我国是不合法规的，现在这种模式使用也越来越少，主要是国家打击加上客户的资金得不到有效保障。所以不建议用户使用。

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