1. 关系：沪港通、深港通是上交所、深交所分别与港交所的互通机制（各含“港股通”和“A股通”）；港股通是前两者的子集，专指内地人买港股的通道，分“沪市下”和“深市下”两种。

2. 买港股范围：沪港通下的港股通只覆盖大/中型股；深港通下的多了“50亿港元以上的小型股”；合起来的港股通范围最广。

3. 账户和费用：用沪A账户走沪港通通道，用深A账户走深港通通道；深港通的过户费、汇兑成本相对更低。

参考汇率:目前，通过深港通和沪港通两个渠道进行的港股通交易，同一交易日使用的参考汇率是一样的（包含参考汇率买入价、参考汇率卖出价）。 

结算汇率:由于深港通和沪港通两个渠道的港股通交易的成交量存在差异，因此同一交易日分别适用的结算汇率（包括结算汇率买入价、结算汇率卖出价）会存在一定差异，但从长期来看，投资者通过两个渠道进行港股通交易所适用的结算汇率将基本在同一水平。